#NEXUS
[29SEPTEMBER 2015]
BEGIN DATA;
	DIMENSIONS  NTAX=21 NCHAR=999;
	FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?;
	MATRIX
	JX877710.1_Viannaia_viannai                -----------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTAGCTTTATTACGTTATTAGTTGATATTGCATATCATTTAAGAAAAATTTTATA-GATAATAAAAAATAAAAATAAAGAGTAGAA--TTTTTTTTTCTTTTATTGTTTCATAATAAAAATTA-AGAAAATTAGAGTTGAAAAGTCGTTCTTTATTATATTTGTTTTGTTTAAAATATTAGAAAATTATATTTT-ATTAA-TTTTTTATTGTAATAAAAAAATTTGAAGTGTTTATTTT-TTAAGTTTTATAACTTTTTATAAGTTTAGAAGTTTGAT-AGTAAAT-TATGTATTTATTAATATTTTAATAAATATTTTATCTTGGAATTAGTAAAATT--ATTTTAAGGTATAAATTAATGTTAATATAATAAAAAAATTCAGTATTCAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTTT-TATAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATGT--TTTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTAAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTGATGATTTTTT-TATTTTGGGTTTGAATTTGTATTTGTATAAAAAATTATAATTGTAATTAAACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTATTTAAACTTTGTGG--A---TTCATAAATTTTAAAATTTTCTAGGGCAGAATAATATAT--ATTAAAATTTTCTATTGATAATTTAAAGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATGCTTAATCTAGTTCTTATAGTATAGTAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTGGGTATATTAAGAAAGGAGAAAACTTAATAATTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAATTCAACGTGATATTAGTTTAATTCATTGTGAGATAGAAT-
	JX877700.1_Viannaia_viannai                ---------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTAGTTTTATTATGTGTTATTAGTTGATATTGCATATCATTTAAGAAAAATTTTATA-GATAATAAAAAATAAAAATAAGGAGTAGAG--TTTTTTTTTCTTTTATTGTTTCATAATAAAAAATA-AAAAAATTAGAGTTGAAAAGTCGTTCTTTATTATATTTGTTTTGTTTTAAATATTAGAAAATTATATTTT-ATTAA-TTTTTTATTGTAATAAAAAAATTTGAAGTGTTTATCTT-TTAAGTTTTATAACTTTTTATAAGTTTAGAAGTTTAGT-AATAAATTATGTAATTTATTAATATTTTAATAAATATTTTATCTTGGAATTAGTAAAATT--ATTTTAAGAAATAAATTAATGTTAATATAATAAAAAAATTCAGCATTCAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTTT-TATAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATGT--TTTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTAAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTGATGATTTTTT-TATTTTGGGTTTGAATTTGTATTTATATAAAAAATTATAATTGTAATTAAACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTATTTAAACTTTGTGG--A---TTCATGTAGTTTAAAATTTTCTAGGGCAGAATAATATAT--ATTAGAATTTTCTATTAATAATTTAAAGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATGCTTAATCTAGTTCTTATAGTATAGTAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTGGGTATATTAAGAAAGGAGAAAACTTAATAATTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAATTCAACGTGATATTAGTTTAATTCATTGTG----------
	JX877702.1_Viannaia_viannai                ---------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTAGTTTTATTATGTGTTATTAGTTGATATTGCATATCATTTAAGAAAAATTTTATA-GATAATAAAAAATAAAAATAAGGAGTAGAA--TTTTTTTTTCTTTTATTGTTTCATAATAAAAAATA-AAAAAATTAGGGTTGAAAAGTCGTTCTTTATTATATTTGTTTTGTTTAAAATATTAGAAAATTATATTTT-ATTAA-TTTTTTATTGTAATAAAAAAATTTGAAGTGTTTATCTT-TTAAGTTTTATAACTTTTTATAAGTTTAGAAGTTTAGT-AATAAATTATGTAATTTATTAATATTTTAATAAATATTTTATCTTGGAATTAGTAAAATT--ATTTTAAGAAATAAATTAATGTTAATATAATAAAAAAATTCAGCATTCAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTTT-TATAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATGT--TTTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTAAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTGATGATTTTTT-TATTTTGGGTTTGAATTTGTATTTATATAAAAAATTATAATTGTAATTAAACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTATTTAAACTTTGTGG--A---TTCATATAGTTTAAAATTTTCTAGGGCAGAATAATATAT--ATTAGAATTTTCTATTGATAATTTAAAGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATGCTTAATCTAGTTCTTATAGTATAGTAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTGGATATATTAAGAAAGGAGAAAACTTAATAATTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAATTCAACGTGATATTAGTTTAATTCATTGTGAGATAGAATA
	JX877701.1_Viannaia_hamata                 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTATTAAAATTAGTTTATTAGTAGATATTGCATATCATTTTAAGAAAATTTTATA-GATAATAAAAAATAAAAATAAAAGGTAGAA--AATCTTGTATTTTTATTGTTTCATAATAAAAAATA-AGGGTTTTAGTGTTGAAAAGTCGACTTTTATTATATTTGTTTGTTTTATAGATATTAGAAAATTATATTTAGTTTA-AG-AAAGTGGTAAGTTTAAAATTTGAAGTGTTTTA-TATTCTGGTTTTATAACTGGTTATATAATATTG-TTTTGGT-----TTAATTAAAATTTATTAATGCTGTAATAAATAAATTATTTAAAAATTAGTAAAT----GTTTTAA?AAGGTAATTAATTATAATATAACAAAAAAATTCAGTATTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTTT-ATTAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGAAAT--ATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTAAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATGATTTTTT-TGTTTTGTATTTGAATTTATTTTTATATAAAAAAATATAACTATAATTATACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTTAAATATAATATTTT---TTTATTATATTTAAAATTTTCTAGGGCAGAATAATATAT--ATTTTAAATTTCTATTAATAATTTAAGGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATACTAGATCTAGTTCTTATAGTATAGTAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTGGATAATTTAAGATAGGAGAAAACTTAATTTTTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAATTCAACGTGATATTAGTTTAATTCA---------------
	JX877709.1_Viannaia_hamata                 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTATCTTAGATTGTTTATTGATAGGTATTGCATATCATTTTAAGAAAATTTTATAGAATAATAAAAAATAAAAATAAAAGGTAGAG--AATTTTATATTTTTATTGTTTCATAATAAAAAATA-AAAATTTTAGTGTTGAAAAGTCGTCTTTTATTATAATTGTTTTTTGTGAGTATATTAGAAAATTATATTTTTTATG-TATTTAATAGTAATTTTAAAATTTGAAGTGTTTTATTTTTCTGGTTTTATAACTGATTATTTTGTTTTT-ATGTTGT-TTAAAGTTAGGTTATTTATTAATTTTATAATAAATATATTATTTAAAGATTAGTAAAT-G--TAATTTATTAAGTAAATTATTTTAATATAACGAAAAAATTCAGTATTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTTT-ATTAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATAT--ATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTAAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATGATTTTTT-TGTTTT-TATTTGAATTTGTGTTTATATAAAAAAATATAAGTATAATTAAACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTTAAATACAATAT--T---GTTATTATATTTAAAATTTTCTAGGGCAGAATTATATAT--ATTTTGGGTTTCTATTTATAATTTTAGGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATACTAGATCTAGTTCTTATAGTATAGTAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTGGATATATTAAGATAGGAGAAAACTTAATTATTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAATTCAACGTGATATTAGTTTAATTCATTGTGAGATAGAAAT
	JX877711.1_Viannaia_minispicula            -----------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTAATTTGTGTTAATAATATTTAGATATTGCATATCATTTTAAGAAAATTTTATT-GTTAATAAAATATAGAAATGGTAGGTAGAA--GATTCTTTTATTTTATTGTTTCATAATAAAAATTA-AGAATTTTGGTGTTGAAAAGTCGGCTACCGTGATATTTGTGTTAGATTTGGTATTAGAAATTTATATTGTTTAGTCAGTAATTGATATAATTTTAAAATTTGAAGTGT-TTTTATTACTAGTTTTATAACTAATTATGTGATTAAATTAAG-------TTTATTTAATATTTATTAATTCTTTAGTAGATATATTATTTAAAAATTAGTAAATTA--ATGAATGAGTTGTAATAATGGTAAATTTAATAAAAAAATTAGGTATTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTAT-ATTAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATAA--ATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTGAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATGATTTTTT-TATTTTGTTTTTGAATTTATATAAATATAAAAAATTATTTATATAGTTAAACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTTAGTTTTATTGTATT----TCAATAATGTTAAAATTTTCTAGGGCAGAATAATATATATTAAATTTATTTCTATTAATAATTTAATGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATACTTAATCTAGTTCTTATAGTAGAGTAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTGAATATATTAAAAAAGGAGAAGATTTAAATATTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAATTCAACGTGATATTAGTTTAATTCA---------------
	JX877705.1_Viannaia_didelphis              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTAACTTTTTTGATTTATATTTAGATATTGCATATCATTTTAAGAAAATTTTATT-GTTAATAAAAAATAGAAATGAAAGGTAGAA--AAATTTTTACTTTTATTGTTTTATAATAAAAATTA-AAATTTTTAGGGTTGATAAGTCGACTTTTATAATACTTGTTTTATATCAAATATTAGAAATTTATATTAGGAAATTATTATAATG--TAATTAGATAATTTGAAGTGTTAATTCATTCTAGTTTTATAACTAATTATGCTGTTGTATTTTTT---TTAATAAGTGTAAATTTATTAAGTTTTTAATAAATTGATTATTTAAGAATTAGTAAATTT--AAT-TTATAGGGTAATATTTTTTAATATAATAGAAAAATTCAGTATTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTTT-TATAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGAGAT--ATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTGAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATGATTTTTT-TATTTTATTATTGAATTTTCATAAGTATAAAAAATTATTTATATAATTAAACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTTAAATTTTTTGTTTT----CAAGAA-ATTTAAAATTTTCTAGGGCAGAATAATATATAT-TATTTTTTTTCTATTAATAATTAATAGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATATCTAATCTAGTTCTTATAGTAGGATAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTGAATATATTAAAAAAGGAGAAGATTTAAATGTTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAATTCAACGTGATATTAGTTTAATTCATTGTGAG--------
	JX877712.1_Viannaia_didelphis              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------ATTAATTTTTTTGATATATATTTAGATATTGCATATCGTTTTAAGAAAATTTTATT-GTTTATAAAAAATAGAAATAAAAGGTAGAA--AAATTTTTACTTTTATTGTTTTATAATAAAAATTA-AAATTTTTAGGGTTGATAAGTCGACTTTTATGATACTTGTTTTGTATAAAATATTAGAAATTTATATTAGAAAATTATTATAATG--TAATTAAATAATTTGAAGTGTTTATTTATTCTAGTTTTATAACTAATTATGTAATTATATTTTTA---A--TTAGTATGGGGTTTATTAAATTTTTAATAAATTAATTATTTAGGAATTAGTAAATTT--AAT-TCATTGGGTAATATTTTATAATATAATAGAAAAATTCAGTATTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTTTTATAAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGACAT--ATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTGAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATGATTTTTT-TATTTTATTATTGAATTTTTATAAGTATAAAAAATTATTTGTATAGTTAAACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTTAACTTTTTTGTGTT----CAAAAA-ATTTAAAATTTTCTAGGGCAGAATAATATATAT-TATTTTTTTTCTATTGATAATTAATAGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATATCTAATCTAGTTCTTATAGTAGGATAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTGAATATATTAAAAAAGGAGAAGATTTAAATGTTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAATTCAACGTGATATTAGTTTAATTCATTGTGAGATAG----
	JX877698.1_Hassalstrongylus                -----------------------------------------------------------------------------------------------------------ATAATTTTAATTTGTTTATTTATTAGTATTGCATACTATTGTAAGAAAATATTG-T-TTTAACAATAAATAAAAATAAAGAGTAGAA--TTTTTTTTAATTTTATTATTACGTAATAAAAAAT-AAAAAAATTAGAGTTGAAAAGTCGTTTTTTATGATATTTGTATAAGTTAAGTTATTAGAAAATTATAATTTAAAAAA-AAATATATTGTAAATTAAAAAGTTATAGTATTTTTTATTATTGGTTTTATAACAGTTTATTGATTTGTTTTTATT---TAGTTTTATTAATAGTTATTAAGTTTTTAGTAATTATAATATTTATAAATTAGTAAATTA--AGGTAATTAATATAAAAAATTGAAATTTAATTAAAGAAATTGAATATTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTAT-TTTAAAGTTTGCTTCCGCCCAGTGATAT--ATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTGAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATTATTTTTT-AGTTTTATTTTTGAATTTATATTTTTATAAAAAAGTAAGATTATAATTATACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTAAGATAAATATAAT-----TTATTTATTATTAAATTTTCTAGGGCAGAATATTATAT--AATTATTTTTTCTATTAATAATTTAATGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATATCTAATCCAGTTCTTATGGTAAGATAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTAAATAATTTAGAAGAGGAGAAAATCTAATTTTTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAATTTAACGTGATATTAGTTTAATTCATTGTG----------
	V_3379_16S                                 GAGTTACTTTGATAGATAATTTTAAGAGTTGATGTTATTTAAATATGGATT-AAAGCTTTTTAGTTTATTTAAAATGTTTACTTGTGGTGTAAAAGAAAATTAAGCTATAATTTTAATTTATTTATTTATTAGTATTGCATACTATTATAAAAAAATATTG-T-TATAACAATTAATAAAAATAAAGAGTAGAA--TTTTTTTTATTTTTATTGTTACGTAATAAAAAAATAAAGAAATTAGGGTTGAAAAGTCGATCTTTATGATATTTGTTTAAATTTAATTATTAGAAAATTATAATTTTAAAAT-TTATTAATG-TAAATTAAAAAGTTATAGTAT-TTTTATTATTAGTTTTATAACAGTTTATAAATTTTTTATCAAA---GA-TTTATAATTTAATTATTAAAATTTTAATAATTAAAGTATTTATAAATTAGTAAATAA--AACTTAATTATATAATAAGTTAAAATTTAATTAAAGAAATTGAATATTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTAT-TTTAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATAT--GTTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTGAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATTATTTTTT-AATTTTATTTTTGAATTTATATTTTTATAAAAAAGTTAAGTTATAATTATCCAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTAAGGTAAATATTAT-----TTATTTATTATTAAATTTTCTAGGGCAGAATATTATAT--AGTTAGTTTTTCTATTAATAATATAATGAATTACTCCGGAGTTACCAGAAAATCATATCTAATCCAGTTCTTATGGTAAGATAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTAAGTAATTAGAAGAGGAGAAA---------------------------------------------------------------------------
	JW008_16S                                  ----------------------------------ATTTAAATATAGATTAA-AAGCTTTTTAGTTTAAAGAAAAATTTTTATTTGTGGTATAAAGGATTGCAAAGCTATAATTATTATTTGTTTATTTTTTAGTATTGCATACTATTATAGGAAAATGGTG-T-AGACACAATAAATAAAAATAAAAAGTAGAA--TTTTTTTTATTTTTATTGTTACATAATAAAGATT-AAAAAAATTAGGGTTGAAAAGTCGTTTTTTATAATATTTGTTTTATTAATTTTATTAGAAAATTATATAGTTATTTT-TAATACGTG-TAAGTTTAAAAGTTATAGTAT-TTTTATTATTAGTTTTATAACTGTTTATTTTTTTTGT-TGTTT---TGCATTGTTTAATAATTATTAATTTTTTAATAATTTTATAGTTTATAAATTAGTAAATATAGGTTTAATTAATATAAATAGCTAAAATATAATTAGAGAAATTGAATTTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTAT-TTTAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATAT--ATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTGAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATTATTTTCT-AATTT-AATTTTGAATTTATATTTTTATAAAAAAATTAAGTTATAGTTACACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTAAGGTAAATATTTT-----ATGTTTACTATTAAATTTTCTAGGGCAGAATTTTATAT--AATTAGTTTGTCTATTAATAATGTGATGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATATCTAATCCAGTTCTTATGGTAAGGTAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTAAGTAATTTGGAGGAGGAGAAAATCTA---------------------------------------------------------------------
	JW009_16S                                  ----------------------------------ATTTAAATATAGATTAA-CAGCTTTTTAGTTTAAAGAAAAATTTTTATTTGTGGTATAAAGGATTGCAAAGCTATAATTATTATTTGTTTATTATTTAGTATTGCATACTATTATAGGAAAATGTTG-T-AGGCACAATAAATAAAAATAAAAAGTAGAA--TTTTTTTTATTTTTATTGTTACATAATAAAGATT-AAAAAAATTAGGGTTGAAAAGTCGTTTTTTATAATATTTGTTTTATTAATTTTATTAGAAAATTATATAGTTATTTT-TAATATGTG-TAAGTTTAAAAGTTATAGTAT-TTTTATTATTAGTTTTATAACTGTTTATTTTTTTTTGTTGTTT---TGTATTGTTTAATAATTATTAATTTTTTAATAATTATATAGTCTATAAATTAGTAAATATAGGTTTAATTAATATAAATAGTTAAAATATAATTAGAGAAATTGAATTTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTAT-TTTAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATAT--ATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTACTTTTATTGAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATTATTTTCT-AATTT-AATTTTGAATTTATATTTTTATAAAAAAATTAAGTTATAGTTACACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTAAGGTAAATATTTT-----ATGTTTACTATTAAATTTTCTAGGGCAGAATTTTATAT--AATTAGTTTGTCTATTAATAATGTAATGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATATCTAATCCAGTTCTTATGGTAAGGTAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTAAGTAATTTGGAAGAGGAGAAAATCTAA--------------------------------------------------------------------
	JW004_16S                                  ----------------------------------ATTTAAATATAGATTAA-AAGCTTTTTAGTTTAAAGAAAAATTTTTATTTGTGGTATAAAGGATTGCAAAGCTATAATTATTATTTGTTTATTTTTTAGTATTGCATACTATTATAGGAAAATGTTG-T-AGGCACAATAAATAAAAATAAAAAGTAGAA--TTTTTTTTATTTTTATTGTTACATAATAAAGATT-AAAAAAATTAGGGTTGAAAAGTCGTTTTTTATAATATTTGTTTTATTAATTTTATTAGAAAATTATATAGTTATTTT-TAATATGTG-TAAGTTTAAAAGTTATAGTAT-TTTTATTATTAGTTTTATAACTGTTTATTTTTTTTTGTTGTTT---TACATTATTTAATAATTATTAATTTTTTAATAATTATATAGTTTATAAATTAGTAAATATAGGTTTAATTAATATAAATAGTTAAAATATAATTAGAGAAATTGAATTTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTAT-TTTAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATAT--ATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTGAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATTATTTTCT-AGTTT-AATTTTGAATTTATATTTTTATAAAAAAATTAAGTTATAGTTACACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTAAGGTAAATATTTT-----ATGTTTACTATTAAATTTTCTAGGGCAGAATTTTATAT--AATTAGTTTGTCTATTAATAATGAGGTGAATTACTCTGGAGTTAACAGAAAATCATATCTAATCCAGTTCTTATGGTAAGGTAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTAAGTAATTAGGAAGAGGAGAAAATCTAA--------------------------------------------------------------------
	JX877706.1_Travassostrongylus_sp.          -----------------------------------------------------------------------------------------------------------ATAAATTTTATTATTTTAATTATTGGTATTGCATACTATTAAAAGAAAATTTTA-T-TAATATAAAATATAGAAATAGAGAGTAGAA--TCTATATTATTTATATTGTTTCATAATATTAATTATATAGTACTAGAGTTGAAAAGTCGTTCTTTATTATAACTGTTTAAAAATATATATTAGAAATTTATATTATTTA-TTATTATTTTTTATAAGTCAATAAGTTGAAGTAT-TATATTTTCAGGTTTTATAACTTTTTATATCATAATAAAATTGTTAAATTTTAAATTATATTATTAAATTGTTTAATAATTAAAGTATTTTTAAATTAGTAAGTT---TTATTTATATAATTTGTATTTTTAATTTGACATGATAAATCAAAATTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTAT-TTTAAAGTTTGCTTCTGCCCAATGATAT--TTTTAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTGAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTATTTATTTTCT-TGTCTTATTATTGAATTTTTATTTATATAAAAAATTATATGTGTAATTAAACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTTGGTAATTGATAATTTTATT-ATCTTTATTAAAATTTTCTAGGGCAGAAATTTAAATA-ATTAATTATTTCTATTAATAAATTATAGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATATCAAATCTAGTTCTTATAGTATGATAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTAAGTATATTAAGAAAGGAGAAGATTTAAATATTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAACTTAACGTGATATTAGTTTAATTCAT--------------
	JX877699.1_Travassostrongylus_callis       -----------------------------------------------------------------------------------------------------------ATAAACCTTTTTGTATTATTTATAGGTATTGCATACCATTAAAGAAAAATTTTA-T-AAATATAAAATATAGAAATAAAGAGTAGAG--TTTATATTAATTATATTGTTTCATAATATTAATTATATA-AATTAGTGTTGAAAAGTCGTTCTTTATTATAACTGTTTTAGTATGTGTATTAGAAATTTATATTTGTTTATTTTTATTTATTATAATTTTATAAGTTGAAGTAT-TATATTTTCTGGTTTTATAACTATTTATAATTTATAAATTTTA-TTT---TTATGAATTAATTATTAAATTTTTAATAATTATATAATTTTTAAATTAGTAAAATG--A-TTTAGAATTATTTTTTTTTATAATATGACTTGAGAATTCAAATTTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTAT-TTTAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATAG-TATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTAAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATTGTTTTCT-TGTCTTGTTATTGAATTTTTTTTTATATAAAAAATTATAGGTGTAATTAAACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTTTAATATTAATATTATTTTTATTAATGTTAAAAATTTTCTAGGGCAGAAATTTATATA-ATTTATTATTTCTATTAATAATTTAAAGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATATCAGATCTAGTTCTTATAGTATGATAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTAAGTATATTAAAAAAGGAGAAGATTTAAATATTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAACTTAACGTGATATTAGTTTAATTCATTGTG----------
	JX877707.1_Travassostrongylus_orloffi      -----------------------------------------------------------------------------------------------------------ATAAGATTAATTTATTTATTTTTAGGTATTGCATACCATTAAAAAAAAATTTTA-T-TTATATAAAATATAGAAATAAAGAGTAGAA--TTTGTATTAATTATATTGTTACATAATATTAATTATATA-AATTAGTGTTGAAAAGTCGTTCTTTATTATAACTGTTTTGTTTAATGTATTAGAAATTTATATTTGTTGTTATTTA-TTGTTATAATTATATAATTTGAAGTGT-TATATTTTCTAGTTTTATAACTGTTTATTGTTTTTATAAATTTTGCT---TTGTTATTTTATTATTAAATTTTTAATAATTATATAATTTTTAAATTAGTAGATTA--ATTTTTAAGTTATTTTTTTTTTTAATATGACTAGAGAAATCAAATTTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTAA-TTTAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATAA-TATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTGAGTTCCAGTATGAATGAGTTATTGGTTAATTG-TTTTCT-TGTCTTATTATTGAATTTTTTTTTGTATAAAAAATTACAATTGTAATTAAACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTTTAATATTAATATT--TTTTATTAGTATTAAAAATTTTCTAGGGCAGAAATTTATATA-ATTTATAATTTCTATTAATAAATTATAGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATATCAGATCTAGTTCTTATAGTATGATAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTAAGTATATTAAAAAAGGAGAAGATTTAAATATTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAGCTTAACGTGATATTAGTTTAATTCATTG------------
	JX877704.1_Austrostrongylus_victoriensis   -----------------------------------------------------------------------------------------------------------ATAAGTTTGTTTTATTTATTAATAGGTATTGCATACCGTTTTAGGAAAATTTTATA-AATTATGAAATATAAAAATAAAAGGTAGAATATATTAATTAATTTTGTTGTTTCATAACAAGAATTA-TTAGTATTAGGGTTGATATGTCGACTTTTATGATATTTGTTTCATCGATTACATTAGAAAATTATGTATTATTAA--AAATTTAGGGTAAATTAATAAGTTGAAGTAT-TATTATTTTAAGTTTTATAACTTTTTATCATAGTTATTGGTA------CACTATTTTTTATTTATTAAGTTTTTAATAAATAAATTATTTAAAAATTAGTAAATTG--GT-TTTATAATATAATTAATTATAATTTAATAAGATAATTCAGATATTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTAT-ATTAAAGTTTGCTTCTGCCCGGTGATAA--ATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTGAGTTCCAGTATGAATGGAGTTATTGGTTAATTTATTTTC-TTATTTTAAATTGAATTTTTATTTGTATAAAAAAGTATAGTTGTAATTAAACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTTTTTTTAATATGCTTATGA----TTTTTGTATATTAAAGTTTTCTAGGGCAGAATTTTATATA-ATTTGTTATTTCTATCGATAATTTAATAAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATACCTAATCTAGTTGTTATAGTGGGGTAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTAAGTATATTAAAAAAGGAGAAGATTTAGTAATTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAACTTAACGTGATATTAGTTTAATTCATTGTG----------
	LL207500.1_Heligmosomoides_polygyrus       --GTAACTTTAATAGATAATTTTAAGAGTTGGTGTTATTTGAATATGGATT---AGCTATTTAGTTTATTTAAAATTTTTACTTGTGGAGTAAAGGAATTTTTAGCTATAAATGTAAATTATTTATTTATTGATATTGCATATCATTGTAATAAAATTTTATT-GTATATAAAAAATAGAAATGGGAGGTAGAA--TATTTATTAGTTTTATTGTTTCATAATAATAATTA-TAAATGTTAGTGTTGAAAAGTCGTCTTCCATTATAACTGTTTTAAATATTATATTAGAAAATTATATTATTTGTTATTAATTATTAGTAAAATTAAAAGTTGAAGTAT-TTTTATTTCTGGTTTTATAACTTATTATTTATTTTGAGAAAGA-----TTTATGTGATTATTTATTAAATTTTTAATAAATATTTTATTTACACATTAGTAAATTT--AT-TTTAATATATCTTTATTTATAATATAAAGGGAAAATTAAGAATTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTAT-ATTAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATTT--ATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTGGGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATTATTTTCT-TTTTTTATTTTTGAATTTTTATTTATATAAAAAAATATAATTATGATTAAACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTTTGTTGTTAACGTG-----AGTTAATAATAAAAATTTTCTAGGGCAGAATTTTATATA-AATGTATTTTCTATTTTATAATTTTAAGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATATCTAATCTAGTTCTTATAGTAAGATAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTAAGTATATTGAGAAAGGAGAAGATTCAATAATTAAGACTGTTCTTCTTTTAATTAACTTAACGTGATATTAGTTTAATTCATTGTGAGATAGAAT-
	JX877708.1_Carolinensis_perezponcedeleoni  -----------------------------------------------------------------------------------------------------------ATAAATCATAATTGTATATTTTTTAGTATTGCATACTATTGTAAGAAAATTTTATT-TTTAATAAAAAATAGAAGCAAAAGGTAGAA--TTTTTTTTATTTTTATTGTTTCATAATAAAGATTA-AAAAAGTTAGGGTTGAAAAGTCGACTTTTGTGATATTTGTTTTTTTTTTTAATGTTAGAAATTTATGTTTTGGCGA-AGTAAATAGGTAAATGTAAAAGTTAAAGTAT-TTTTATTTTTAGTTTTATAACTGTTTATTTAAGTGTTTTTGGG---TTTAAGTTTTTATATTTATTAAATTTTTAATAAGTTAATAATTTATAAATTAGTATATTA--TATTTATAGCTGTATAAAAATAAAATATAAAAGGAAAATTCAAAGTTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTAT-TTTAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATAT--ATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTGAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATTATTTTCT-TTTTTTTATATTGAATTTGTATTTTTATAAAAAAGTAAAGTTATAATTATACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTTGAATAAATAATTA-----TTATTTGTTTAAAATTTTCTAGGGCAGAATATTAAATA--ATGTTATATTTCTATTAATAATTTTAAGAATTACTCCGGAGCTAACAGAAAATCATACTTAATCCAGTTCTTATGGTAAAGTAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTAAGTTTTTTAGGAGAGGAGAATACCTAATA------------------------------------------------------------------
	JX877703.1_Odilia_sp                       -----------------------------------------------------------------------------------------------------------TTAAGTTATTTTTTTTTATTTTTTAGTATTGCATACTATTGTAGGAAAATTTT-AT-ATTAATAAAAAATAGAAATAAAAGGTAGAA--TTTTTTTTTCTTTTGTTGTTTCATAACAAAAAATA-AAAAAATTAGAGTTGAAAAGTCGTCTTTTATGATATTTGTTTTATTTTATTATTTTAGAAAATTATGTTTATTTGT-GTTTTTAGTGTAATTATAAAAGTTAAAGTAT-TTATTTTTTAAGTTTTATAACTTATTATTTTTTATAATTTGTG---AATTGGTTTTGTTGTTTGTTAATATTTTAACAAATTTATTATCTATATATTAGTAGATTT--TT-GTTAAGTTGTTTTTATATATAATATAATAAAAGAATTCAAAAATTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGACTTTAT-TTTAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGATAATTTTTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTATCTTTATTGGGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATAATTTTTT-TATTTTGTTATTGAATTTTTATCTGTATAAAAAATTATAGTTATAATTATACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTTAATCAAAATTT-T-----TCATTTTGATTAAAATTTTCTAGGGTAGAATTTTATAT--AATTTTGTTTTCTATTAATAAATTAAAGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATACCTAATCTAGATCTTATAGTAAGGTAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTAAGTATTTTAAGAAGGGAGAAGATTTAAATATTAAGACTGTTCTTCTTGTAATTAACTTAACGTGATATTAGTTTAATTC----------------
	LM440322.1_Nippostrongylus_brasiliensis    --GTAACTTTAATAGATAATTTTAAAAGTTGGTGTTATTTAAATATAGATTAAAAGCTATTTAGTTTATTTAAAATATTTATTTGTGGTATAAAGGAATTAATGGCTTTAAATTTTAATTTTTTATTTTTTAGTATTGCATACTATTATATGAGAATTTT-AT-GTTAATAAAATATAGAAATAAAGAGTAGAA--TTTTTTTTTGTTTTGTTGTTTCATAACAAAGATTA-AAAAAATTAGTGTTGAAAAGTCGTTCTTTATTATATTTGTTTTGTTAGTTATATTAGAAATTTATATTGTTTTA-T-TATTACTTTTTAAAATAATGACTTAAAGTAT-CATTATATTTAGTTTTATAACTGTTTATTTGTATGAATTTTTT---TTTTTAAAAAATTAATTATTAATTTTTTAATAATTTTATTATATATAAATTAGTAGATTT--TTTATAATGATATTATTAGTAATAATATAATAAGAAAACTCAAAGTTTAATCAAATGTTTTTTAAAGACTTAGGCTTTAT-ATTAAAGTTTGCTTCTGCCCAGTGAAA---ATTAAATGGCAGTCTTAGCGTGAGGACATTAAGGTAGCAAAATAATTTGTGCTTTTATTGAGTTCCAGTATGAATGAAGTTATTGGTTAATTTATTTTCTTATTTTATTATTGAATTTATATCTAAATAAAAAAATTTAGTTGTAATTAAACAAAGATAAGTCTTCGGAAATTCTTTTTAAATTAAAAATTT-----GTTTTTTATTTAAAATTTTCTAGGGCAGAATATTATAT--AATTGTTATTTCTATTAATAATTTTGTGAATTACTCCGGAGTTAACAGAAAATCATACCTAATCTAGTTCTTATAGTAAGGTAAGTTTTACATCGATGTTGTATTTAAGTTTATTAAAAAAGGAGAAGATTTAATTATTAAGACTGTTCTTCTTTAAATTAACTTAACGTGATATTAGTTTAATTCATTGTAAGATAGAAT-

;


END;
[
begin mrbayes;
	set autoclose=yes nowarn=yes;
	exclude 1 - 107 164 195-196 530 990-999;
	lset nst=6 rates=invgamma;
	unlink statefreq=(all) revmat=(all) shape=(all) pinvar=(all); 
	prset applyto=(all) ratepr=variable;
	mcmcp ngen= 10000000 relburnin=yes burninfrac=0.25 printfreq=10000  samplefreq=1000 nchains=4 savebrlens=yes;
	mcmc;
	sumt;
end;
]

[PAUP* Commands Block:
 If you want to load the selected model and associated estimates in PAUP*,
 attach the next block of commands after the data in your PAUP file:
]
[!
Likelihood settings from best-fit model (TPM1uf+G) selected by AIC
with jModeltest 0.1.1 on Fri Sep 25 10:41:57 CDT 2015]	

BEGIN PAUP;
log file=GuerrerostrongylusOCTOBER.log start;
Lset base=(0.3656 0.0298 0.1174) nst=6  rmat=(1.0000 7.9614 1.5852 1.5852 7.9614) rates=gamma shape=0.2230 ncat=4 pinvar=0;
exclude 1 - 107 164 195-196 530 990-999;

set autoclose=yes warnreset=no increase=auto;
set criterion=Likelihood;
HS;
	savetrees brlens=yes maxDecimal=4 file=outputGuerrerostrongylusOCT_ML.tre replace=yes;

BOOTSTRAP nreps=1000 search=heuristic /addseq=random;
	savetrees from=1 to=1 savebootp=nodelabels file=GuerrerosBOTSTRAPML_K.tre;

SET CRITERION=parsimony;
exclude 1 - 107 164 195-196 530 990-999;
hs;
	savetrees brlens=yes maxDecimal=4 file=outputGuerrerostrongylusPARS_K.tre replace=yes;
showtrees all;
contree all /treefile=GuerrerosParsimonyOCT.tre;

BOOTSTRAP nreps=1000 search=heuristic /addseq=random;
	savetrees from=1 to=1 savebootp=nodelabels file=GuerrerosBOTSTRAPparsimony_K.tre;
	
END;